Công văn 4113/QNI-QLDN2 được Thuế tỉnh Quảng Ninh ban hành ngày 17/8/2026 nhằm tháo gỡ vướng mắc về chính sách thuế nhà thầu nước ngoài và thuế giá trị gia tăng đối với hợp đồng xây dựng, cung cấp máy móc thiết bị cho doanh nghiệp chế xuất. Trong bối cảnh các văn bản pháp luật như Nghị định 320/2025/NĐ-CP, Thông tư 20/2026/TT-BTC, Nghị định 252/2026/NĐ-CP và Thông tư 89/2026/TT-BTC đi vào thực thi, việc nắm vững tinh thần chỉ đạo tại công văn này giúp doanh nghiệp tuân thủ đúng quy định và tối ưu chi phí thuế.
Thực tế quản trị tài chính tại các doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài (FDI) và doanh nghiệp chế xuất (EPE) cho thấy, giao dịch mua sắm máy móc thiết bị kèm dịch vụ lắp đặt thường tiềm ẩn nguy cơ bị ấn định thuế hoặc xử phạt vi phạm hành chính do kê khai sai thời điểm. Công văn 4113/QNI-QLDN2 đóng vai trò như một cẩm nang nghiệp vụ quan trọng, giúp bộ phận kế toán xử lý chuẩn xác nghĩa vụ khấu trừ tại nguồn và nộp hồ sơ kê khai thuế năm 2026.
Tóm tắt trọng tâm về Công văn 4113/QNI-QLDN2
- Công văn 4113/QNI-QLDN2 là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ do Thuế tỉnh Quảng Ninh ban hành ngày 17/8/2026 giải đáp về thuế nhà thầu nước ngoài và thuế giá trị gia tăng thuộc hợp đồng xây dựng cung cấp máy móc thiết bị.
- Văn bản áp dụng cho các doanh nghiệp Việt Nam, doanh nghiệp chế xuất ký kết hợp đồng thương mại, xây dựng, lắp đặt với tổ chức, cá nhân nước ngoài.
- Quy định làm rõ điều kiện miễn nộp hồ sơ khai thuế tháng khi không phát sinh số thuế khấu trừ, hệ thống biểu mẫu chuẩn theo Thông tư 89/2026/TT-BTC và thời hạn nộp tờ khai theo Nghị định 252/2026/NĐ-CP.
Bối cảnh pháp lý ban hành Công văn 4113/QNI-QLDN2 và vai trò trong quản trị thuế 2026
Giai đoạn 2025 – 2026 đánh dấu bước cải cách lớn trong hệ thống quản lý thuế tại Việt Nam với sự xuất hiện của đồng bộ các văn bản quy phạm pháp luật mới. Sự thay đổi này đòi hỏi người làm công tác tài chính kế toán phải cập nhật liên tục để đảm bảo tính tuân thủ. Công văn 4113/QNI-QLDN2 được ban hành nhằm trả lời trực tiếp các vướng mắc phát sinh từ thực tế vận hành của doanh nghiệp trên địa bàn tỉnh Quảng Ninh.
Trong hoạt động sản xuất kinh doanh, các doanh nghiệp chế xuất thường xuyên nhập khẩu máy móc, thiết bị, nguyên vật liệu từ thương nhân nước ngoài thông qua hình thức lưu kho ngoại quan hoặc khu phi thuế quan. Đồng thời, các dự án mở rộng nhà xưởng thường phát sinh hợp đồng xây dựng, lắp đặt máy móc trọn gói. Việc xác định đúng nghĩa vụ thuế nhà thầu và thuế giá trị gia tăng đối với các chuỗi giao dịch phức tạp này là bài toán khống chế rủi ro hàng đầu.
Các căn cứ pháp lý cốt lõi được trích dẫn trong Công văn 4113/QNI-QLDN2 bao gồm:
- Khoản 3 Điều 12 Nghị định 320/2025/NĐ-CP quy định về đối tượng chịu thuế nhà thầu.
- Khoản 2 Điều 7 Thông tư 20/2026/TT-BTC hướng dẫn nghĩa vụ nộp hồ sơ khai thuế theo tháng.
- Khoản 8 Điều 11 và Điều 10 Nghị định 252/2026/NĐ-CP quy định thời hạn nộp hồ sơ khai thuế.
- Phụ lục 1 ban hành kèm theo Thông tư 89/2026/TT-BTC quy định chi tiết bộ hồ sơ khai thuế nhà thầu nước ngoài.
Theo góc nhìn từ MAN – Master Accountant Network, việc nắm bắt kịp thời các văn bản hướng dẫn như Công văn 4113/QNI-QLDN2 giúp doanh nghiệp chủ động trong khâu đàm phán hợp đồng quốc tế, tránh các khoản chi phí phát sinh ngoài dự kiến do hiểu sai nghĩa vụ thuế nộp thay.
Hướng dẫn thuế nhà thầu nước ngoài theo Công văn 4113/QNI-QLDN2
Quy định miễn nộp hồ sơ khai thuế nhà thầu theo tháng trong Công văn 4113/QNI-QLDN2
Điểm tháo gỡ quan trọng nhất tại Công văn 4113/QNI-QLDN2 nằm ở hướng dẫn xử lý trường hợp doanh nghiệp khai thuế nộp thay theo tháng nhưng không phát sinh số thuế khấu trừ trong kỳ.
Căn cứ khoản 2 Điều 7 Thông tư 20/2026/TT-BTC, nếu doanh nghiệp đang thực hiện nộp thay thuế giá trị gia tăng và thuế thu nhập doanh nghiệp cho nhà thầu nước ngoài theo phương pháp khai thuế tháng, trường hợp trong tháng đó không phát sinh việc khấu trừ thuế thì không phải nộp hồ sơ khai thuế nhà thầu nước ngoài.
Quy định này áp dụng cụ thể đối với trường hợp thương nhân nước ngoài bán hàng hóa là nguyên liệu, vật tư, linh kiện tại kho ngoại quan, khu phi thuế quan để nhập khẩu vào Việt Nam phục vụ sản xuất hàng xuất khẩu hoặc gia công hàng xuất khẩu theo hợp đồng đã ký kết.
Hướng dẫn này giải tỏa áp lực thủ tục hành chính rất lớn cho các doanh nghiệp chế xuất và doanh nghiệp gia công xuất khẩu. Bộ phận kế toán không còn phải lập các tờ khai trống (không phát sinh số liệu) hàng tháng, giảm thiểu rủi ro bị phạt chậm nộp do quên nộp tờ khai không phát sinh nghĩa vụ thuế.
Phân tích nghĩa vụ thuế nhà thầu đối với thu nhập phát sinh tại Việt Nam
Tổ chức, cá nhân nước ngoài kinh doanh hoặc có thu nhập phát sinh tại Việt Nam trên cơ sở hợp đồng, thỏa thuận với tổ chức, cá nhân Việt Nam đều thuộc đối tượng chịu thuế nhà thầu nước ngoài. Thuế nhà thầu bao gồm hai cấu phần chính: thuế giá trị gia tăng và thuế thu nhập doanh nghiệp.
Trường hợp hợp đồng cung cấp máy móc, thiết bị có kèm theo các dịch vụ thực hiện tại Việt Nam như tư vấn, giám sát, lắp đặt, vận hành thử, bảo dưỡng, đào tạo:
- Thu nhập từ phần dịch vụ phát sinh tại Việt Nam bắt buộc phải kê khai và nộp thuế nhà thầu.
- Nếu hợp đồng tách biệt được giá trị máy móc thiết bị và giá trị dịch vụ, thuế nhà thầu sẽ áp dụng riêng cho từng phần theo tỷ lệ quy định.
- Nếu hợp đồng không tách biệt được giá trị máy móc và dịch vụ, cơ quan thuế sẽ áp dụng tỷ lệ % thuế TNDN và thuế GTGT trên toàn bộ tổng giá trị hợp đồng.
Các chuyên gia tại MAN với 30 năm kinh nghiệm lưu ý rằng, việc không bóc tách rõ giá trị dịch vụ đi kèm trên hợp đồng mua bán máy móc thiết bị là nguyên nhân hàng đầu khiến doanh nghiệp bị truy thu thuế TNDN nhà thầu với số tiền rất lớn trong các kỳ thanh tra thuế.
Chi tiết hồ sơ khai thuế nhà thầu nước ngoài theo Thông tư 89/2026/TT-BTC được trích dẫn tại Công văn 4113/QNI-QLDN2
Để thực hiện đúng tinh thần chỉ đạo tại Công văn 4113/QNI-QLDN2, doanh nghiệp cần căn cứ vào Phụ lục 1 ban hành kèm theo Thông tư 89/2026/TT-BTC để chuẩn bị đúng và đủ hồ sơ cho từng trường hợp cụ thể.
Phương pháp trực tiếp (Tỷ lệ % trên doanh thu)
Phương pháp trực tiếp áp dụng phổ biến nhất khi bên Việt Nam khấu trừ và nộp thuế thay cho nhà thầu nước ngoài. Nhà thầu nộp thuế GTGT tính trực tiếp trên doanh thu và thuế TNDN theo tỷ lệ % tính trên doanh thu tính thuế.
Hồ sơ khai thuế theo từng lần phát sinh hoặc theo tháng (nếu phát sinh nhiều lần trong tháng):
- Tờ khai thuế nhà thầu nước ngoài theo Mẫu số 01/NTNN (áp dụng đối với bên Việt Nam khấu trừ và nộp thuế thay).
- Bản sao hợp đồng nhà thầu, hợp đồng nhà thầu phụ có xác nhận của người nộp thuế (chỉ nộp kèm trong lần khai thuế đầu tiên của hợp đồng).
Hồ sơ khai quyết toán thuế khi kết thúc hợp đồng nhà thầu:
- Tờ khai quyết toán thuế nhà thầu nước ngoài theo Mẫu số 02/NTNN.
- Phụ lục Bảng kê các nhà thầu nước ngoài theo Mẫu số 02-1/NTNN.
- Phụ lục Bảng kê các nhà thầu phụ tham gia hợp đồng nhà thầu theo Mẫu số 02-2/NTNN.
Phương pháp hỗn hợp
Phương pháp hỗn hợp áp dụng khi nhà thầu nước ngoài nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ, nhưng nộp thuế TNDN theo tỷ lệ % tính trên doanh thu tính thuế.
Hồ sơ khai thuế theo từng lần phát sinh hoặc theo tháng:
- Tờ khai thuế nhà thầu nước ngoài theo Mẫu số 03/NTNN.
- Bản sao hợp đồng nhà thầu, hợp đồng nhà thầu phụ (nộp kèm trong lần khai thuế đầu tiên của hợp đồng).
Hồ sơ khai quyết toán thuế khi kết thúc hợp đồng:
- Tờ khai quyết toán thuế nhà thầu nước ngoài theo Mẫu số 04/NTNN.
- Phụ lục Bảng kê các nhà thầu phụ tham gia hợp đồng nhà thầu theo Mẫu số 02-2/NTNN.
Phương pháp khấu trừ
Phương pháp khấu trừ áp dụng khi nhà thầu nước ngoài có cơ sở thường trú tại Việt Nam, thời hạn kinh doanh theo hợp đồng từ 183 ngày trở lên và thực hiện chế độ kế toán Việt Nam.
- Khai thuế giá trị gia tăng: Thực hiện khai thuế GTGT theo quy định chung áp dụng cho tổ chức kinh doanh tại điểm 4 Phụ lục 1 Thông tư 89/2026/TT-BTC.
- Khai thuế thu nhập doanh nghiệp: Thực hiện khai thuế TNDN theo quy định tại điểm 6 Phụ lục 1 Thông tư 89/2026/TT-BTC.
Hồ sơ khai thuế đối với các ngành nghề đặc thù
Thông tư 89/2026/TT-BTC cũng quy định biểu mẫu riêng cho các trường hợp thương nhân nước ngoài hoạt động trong lĩnh vực vận tải, hàng không và bảo hiểm:
Hãng hàng không nước ngoài (Khai thuế theo quý):
- Tờ khai thuế thu nhập doanh nghiệp đối với hãng hàng không nước ngoài theo Mẫu số 01/HKNN.
- Bản sao hợp đồng nhà thầu, hợp đồng nhà thầu phụ (nộp kèm trong lần khai đầu tiên).
Hãng vận tải nước ngoài (Khai quyết toán thuế năm):
- Tờ khai quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp đối với hãng vận tải nước ngoài theo Mẫu số 01/VTNN.
- Phụ lục bảng kê thu nhập vận tải quốc tế theo Mẫu số 01-1/VTNN (áp dụng cho doanh nghiệp khai thác tàu).
- Phụ lục bảng kê thu nhập vận tải quốc tế theo Mẫu số 01-2/VTNN (áp dụng cho trường hợp hoán đổi chia chỗ).
- Bảng kê doanh revenue lưu công-ten-nơ theo Mẫu số 01-3/VTNN.
Tổ chức tái bảo hiểm nước ngoài (Khai thuế theo quý):
- Tờ khai thuế thu nhập doanh nghiệp đối với tổ chức tái bảo hiểm nước ngoài theo Mẫu số 01/TBH.
- Phụ lục hợp đồng tái bảo hiểm, chứng từ tái bảo hiểm theo Mẫu số 01-1/TBH.
Thời hạn nộp hồ sơ khai thuế nhà thầu theo Nghị định 252/2026/NĐ-CP nêu tại Công văn 4113/QNI-QLDN2
Xác định chính xác mốc thời gian nộp tờ khai giúp doanh nghiệp chủ động trong kế hoạch tài chính và tránh các rủi ro vi phạm hành chính. Căn cứ Điều 10 Nghị định 252/2026/NĐ-CP, thời hạn nộp hồ sơ khai thuế đối với thuế nhà thầu được phân định rõ cho từng hình thức kê khai.
Mốc thời gian nộp tờ khai định kỳ
Khai theo từng lần phát sinh:
- Thời hạn nộp hồ sơ khai thuế chậm nhất là ngày thứ 10 kể từ ngày tiếp theo ngày phát sinh nghĩa vụ thuế.
- Trường hợp đặc biệt: Ngoại trừ trường hợp phải khai và nộp thuế trước khi được cơ quan thuế cấp hóa đơn điện tử có mã cho từng lần phát sinh theo điểm b khoản 3 Điều 26 Luật Quản lý thuế.
Khai theo tháng:
- Thời hạn nộp hồ sơ khai thuế chậm nhất là ngày thứ 20 của tháng tiếp theo tháng phát sinh nghĩa vụ thuế.
Khai theo quý:
- Thời hạn nộp hồ sơ khai thuế chậm nhất là ngày cuối cùng của tháng đầu của quý tiếp theo quý phát sinh nghĩa vụ thuế.
Khai theo năm:
- Thời hạn nộp hồ sơ khai thuế chậm nhất là ngày cuối cùng của tháng đầu tiên của năm dương lịch tiếp theo hoặc năm tài chính tiếp theo.
Mốc thời gian nộp hồ sơ khai quyết toán thuế
Khi hợp đồng nhà thầu kết thúc hoặc chấm dứt hiệu lực, bên nộp thay thuế phải hoàn tất thủ tục quyết toán để thanh xác số thuế phải nộp.
Căn cứ điểm a khoản 5 Điều 10 Nghị định 252/2026/NĐ-CP:
- Thời hạn nộp hồ sơ khai quyết toán thuế chậm nhất là ngày cuối cùng của tháng thứ 03 kể từ ngày kết thúc kỳ quyết toán thuế hoặc kết thúc hợp đồng nhà thầu.
Doanh nghiệp cần lưu ý, thời điểm kết thúc hợp đồng nhà thầu được tính từ ngày hai bên nghiệm thu, thanh lý hợp đồng hoặc hoàn thành việc cung cấp dịch vụ, bàn giao công trình.
Chính sách thuế GTGT đối với hợp đồng xây dựng cung cấp máy móc cho doanh nghiệp chế xuất
Hợp đồng xây dựng, cung cấp và lắp đặt máy móc thiết bị cho doanh nghiệp chế xuất (EPE) có những đặc thụ riêng do vị trí pháp lý của EPE được coi là khu phi thuế quan.
Điều kiện áp dụng thuế suất thuế GTGT 0%
Theo quy định hiện hành được nhắc đến tại Công văn 4113/QNI-QLDN2, hàng hóa, dịch vụ cung cấp cho doanh nghiệp chế xuất thuộc diện áp dụng thuế suất thuế GTGT 0% nếu đáp ứng đủ các điều kiện:
- Có hợp đồng bán, gia công hàng hóa hoặc hợp đồng cung cấp dịch vụ ký kết với doanh nghiệp trong khu phi thuế quan.
- Có chứng từ thanh toán tiền hàng hóa, dịch vụ qua ngân hàng.
- Có tờ khai hải quan theo quy định (đối với hàng hóa cung cấp).
Đối với dịch vụ xây dựng, lắp đặt công trình phục vụ trực tiếp cho hoạt động sản xuất của doanh nghiệp chế xuất thực hiện trong khu phi thuế quan, bên cung cấp dịch vụ được áp dụng thuế suất thuế GTGT 0%.
Xử lý thuế GTGT đối với hợp đồng xây dựng cung cấp thiết bị hỗn hợp
Trong thực tế, nhà thầu nước ngoài hoặc nhà thầu trong nước thường ký hợp đồng trọn gói bao gồm cả việc cung cấp máy móc thiết bị nhập khẩu và dịch vụ thi công xây dựng, lắp đặt tại nhà xưởng của doanh nghiệp chế xuất.
Doanh nghiệp cần lưu ý phân tách rõ ràng hai phần:
- Phần máy móc thiết bị nhập khẩu: Làm thủ tục hải quan nhập khẩu vào khu phi thuế quan, thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT khâu nhập khẩu hoặc áp dụng thuế suất GTGT 0% nếu đáp ứng đủ điều kiện.
- Phần dịch vụ xây dựng, lắp đặt tại Việt Nam: Thuộc đối tượng chịu thuế nhà thầu. Nghĩa vụ thuế GTGT phụ thuộc vào việc nhà thầu nộp thuế theo phương pháp nào và tư cách pháp lý của bên thụ hưởng.
Giải pháp từ MAN – Master Accountant Network khuyến nghị các doanh nghiệp khi đàm phán hợp đồng hỗn hợp bắt buộc phải tách riêng trị giá hàng hóa nhập khẩu và trị giá dịch vụ thi công, lắp đặt. Điều này đảm bảo minh bạch căn cứ tính thuế GTGT và thuế TNDN nhà thầu, tránh tình trạng bị áp thuế đúp hoặc tính thuế trên toàn bộ giá trị gói thầu.
Bảng tổng hợp đối chiếu hồ sơ và thời hạn kê khai thuế nhà thầu năm 2026
Bảng dưới đây tổng hợp chi tiết toàn bộ biểu mẫu và thời hạn kê khai thuế nhà thầu nước ngoài được trích dẫn từ Công văn 4113/QNI-QLDN2, Thông tư 89/2026/TT-BTC và Nghị định 252/2026/NĐ-CP:
| Phương pháp nộp thuế | Loại kỳ kê khai | Biểu mẫu hồ sơ áp dụng (Thông tư 89/2026/TT-BTC) | Thời hạn nộp hồ sơ (Nghị định 252/2026/NĐ-CP) |
| Trực tiếp | Từng lần phát sinh | Mẫu 01/NTNN + Bản sao Hợp đồng (lần đầu) | Chậm nhất ngày thứ 10 kể từ ngày tiếp theo ngày phát sinh nghĩa vụ thuế |
| Trực tiếp | Theo tháng | Mẫu 01/NTNN (Miễn nộp nếu không phát sinh khấu trừ theo Công văn 4113/QNI-QLDN2) | Chậm nhất ngày thứ 20 của tháng tiếp theo tháng phát sinh nghĩa vụ |
| Trực tiếp | Quyết toán hợp đồng | Mẫu 02/NTNN, Phụ lục Mẫu 02-1/NTNN, Phụ lục Mẫu 02-2/NTNN | Chậm nhất ngày cuối cùng của tháng thứ 03 kể từ ngày kết thúc hợp đồng |
| Hỗn hợp | Từng lần / Tháng | Mẫu 03/NTNN + Bản sao Hợp đồng (lần đầu) | Ngày thứ 10 (lần phát sinh) hoặc ngày thứ 20 của tháng sau (khai tháng) |
| Hỗn hợp | Quyết toán hợp đồng | Mẫu 04/NTNN, Phụ lục Mẫu 02-2/NTNN | Chậm nhất ngày cuối cùng của tháng thứ 03 kể từ ngày kết thúc hợp đồng |
| Khấu trừ | Tháng / Quý | Tờ khai thuế GTGT, TNDN theo quy định chung tại điểm 4, điểm 6 Phụ lục 1 | Ngày thứ 20 tháng sau (khai tháng) hoặc ngày cuối tháng đầu quý sau (khai quý) |
| Hàng không | Theo quý | Mẫu 01/HKNN + Bản sao Hợp đồng (lần đầu) | Chậm nhất ngày cuối cùng của tháng đầu quý tiếp theo quý phát sinh |
| Vận tải | Quyết toán năm | Mẫu 01/VTNN, Phụ lục Mẫu 01-1/VTNN, Mẫu 01-2/VTNN, Mẫu 01-3/VTNN | Chậm nhất ngày cuối cùng của tháng thứ 01 năm dương lịch/tài chính tiếp theo |
| Tái bảo hiểm | Theo quý | Mẫu 01/TBH, Phụ lục Mẫu 01-1/TBH | Chậm nhất ngày cuối cùng của tháng đầu quý tiếp theo quý phát sinh |
Case Study thực tế: Phân tích xử lý thuế nhà thầu và hợp đồng máy móc tại Quảng Ninh
Để làm rõ cách áp dụng Công văn 4113/QNI-QLDN2 vào thực tiễn, chúng ta cùng phân tích tình huống thực tế của một doanh nghiệp chế xuất triển khai dự án đầu tư trong năm 2026.
Tình huống doanh nghiệp
Công ty TNHH Precision Electronics (Doanh nghiệp chế xuất 100% vốn FDI tại KCN Sông Khoai, Quảng Ninh) ký hợp đồng mua sắm và lắp đặt dây chuyền sản xuất trị giá 10.000.000 USD với Công ty Global Tech Inc (Trụ sở tại Hàn Quốc).
Chi tiết hợp đồng bao gồm:
- Cung cấp máy móc, thiết bị tự động hóa nhập khẩu từ Hàn Quốc: 8.500.000 USD. Hàng hóa được giao tại kho ngoại quan Hải Phòng trước khi làm thủ tục nhập khẩu về nhà xưởng.
- Dịch vụ thiết kế, thi công lắp đặt, hiệu chỉnh và đào tạo vận hành tại nhà xưởng Quảng Ninh: 1.500.000 USD.
Global Tech Inc lựa chọn phương pháp nộp thuế trực tiếp, giao cho Precision Electronics khấu trừ và nộp thay thuế nhà thầu.
Cách thức xử lý và kết quả áp dụng quy định
Trong tháng 4/2026, Precision Electronics nhập khẩu toàn bộ lô máy móc trị giá 8.500.000 USD từ kho ngoại quan về nhà xưởng. Phần dịch vụ lắp đặt trị giá 1.500.000 USD chưa phát sinh nghiệm thu và chưa thanh toán.
Xử lý thuế cho tháng 4/2026:
- Căn cứ Công văn 4113/QNI-QLDN2 và khoản 2 Điều 7 Thông tư 20/2026/TT-BTC, đối với lô máy móc 8.500.000 USD nhập khẩu từ kho ngoại quan để sản xuất xuất khẩu, do trong tháng 4 chưa phát sinh việc khấu trừ thuế cho phần dịch vụ, Precision Electronics không phải nộp tờ khai Mẫu 01/NTNN cho kỳ tháng 4/2026.
Xử lý thuế khi thanh toán dịch vụ lắp đặt (Tháng 6/2026):
- Khi hoàn thành nghiệm thu và chuyển khoản thanh toán 1.500.000 USD cho Global Tech Inc, Precision Electronics thực hiện khấu trừ thuế TNDN nhà thầu đối với dịch vụ theo tỷ lệ 5%.
- Số thuế TNDN nhà thầu nộp thay = 1.500.000 USD x 5% = 75.000 USD.
- Do nghiệp vụ phát sinh trong tháng 6, thời hạn nộp Tờ khai Mẫu 01/NTNN kèm bản sao hợp đồng chậm nhất là ngày 20/7/2026.
Tác động tài chính:
Nếu không tách riêng giá trị dịch vụ 1.500.000 USD và máy móc 8.500.000 USD trên hợp đồng, cơ quan thuế sẽ áp tỷ lệ thuế TNDN 2% trên toàn bộ tổng hợp đồng 10.000.000 USD. Khi đó, số thuế nộp thay bị đẩy lên mức 200.000 USD. Việc bóc tách hợp đồng chuẩn xác ngay từ đầu giúp doanh nghiệp tối ưu chi phí thuế hợp pháp 125.000 USD.
Nhận định chuyên gia từ MAN – Master Accountant Network về rủi ro thuế nhà thầu năm 2026
Trong quá trình đồng hành cùng hàng trăm doanh nghiệp FDI và doanh nghiệp sản xuất tại Việt Nam, các chuyên gia của chúng tôi nhận thấy nhiều điểm mù pháp lý mà doanh nghiệp thường xuyên vướng phải.
Nhầm lẫn giữa điều kiện Incoterms và nghĩa vụ thuế nội địa
Một sai lầm rất phổ biến của bộ phận mua hàng là cho rằng hợp đồng mua bán máy móc ký theo điều kiện CIF hoặc FOB thì hoàn toàn không phát sinh thuế nhà thầu. Ngược lại, nếu ký theo điều kiện DDP thì mặc nhiên phải nộp thuế nhà thầu trên toàn bộ trị giá.
Các chuyên gia tại MAN với 30 năm kinh nghiệm lưu ý rằng, bản chất của thuế nhà thầu phụ thuộc vào việc tổ chức nước ngoài có thực hiện dịch vụ gắn liền với hàng hóa tại lãnh thổ Việt Nam hay không. Ngay cả khi ký hợp đồng FOB, nhưng nếu bên bán cử chuyên gia sang Việt Nam hướng dẫn lắp đặt và đào tạo, phần chi phí dịch vụ đó (hoặc toàn bộ hợp đồng nếu không tách riêng được) vẫn thuộc diện chịu thuế nhà thầu.
Bỏ quên thủ tục nộp hồ sơ quyết toán khi thanh lý hợp đồng
Nhiều doanh nghiệp thực hiện kê khai và nộp thuế nhà thầu đầy đủ theo từng lần thanh toán tiền cho đối tác nước ngoài, nhưng lại bỏ qua bước nộp hồ sơ khai quyết toán thuế nhà thầu khi kết thúc hợp đồng.
Theo Nghị định 252/2026/NĐ-CP, thời hạn nộp hồ sơ quyết toán là ngày cuối cùng của tháng thứ 03 kể từ ngày kết thúc hợp đồng. Việc thiếu tờ khai quyết toán Mẫu 02/NTNN hoặc Mẫu 04/NTNN khiến dữ liệu trên hệ thống quản lý thuế tập trung của cơ quan thuế bị treo. Điều này gây hóc mắc lớn khi doanh nghiệp thực hiện thủ tục hoàn thuế GTGT hoặc làm thủ tục đóng mã số thuế, giải thể sau này.
Để giải quyết triệt để các rủi ro nêu trên, giải pháp từ MAN – Master Accountant Network hỗ trợ doanh nghiệp rà soát toàn bộ hệ thống hợp đồng thương mại quốc tế, chuẩn hóa quy trình lập chứng từ thanh toán và đại diện doanh nghiệp thực hiện trọn gói thủ tục kê khai, quyết toán thuế chuẩn xác với cơ quan quản lý.
Kết luận
Công văn 4113/QNI-QLDN2 năm 2026 của Thuế tỉnh Quảng Ninh mang lại những hướng dẫn nghiệp vụ kịp thời và thiết thực, giải tỏa thắc mắc cho doanh nghiệp về nghĩa vụ nộp hồ sơ khai thuế nhà thầu và chính sách thuế GTGT hợp đồng xây dựng. Việc áp dụng chuẩn xác hệ thống biểu mẫu theo Thông tư 89/2026/TT-BTC cùng các mốc thời gian kê khai, quyết toán quy định tại Nghị định 252/2026/NĐ-CP là cơ sở vững chắc giúp doanh nghiệp duy trì tính tuân thủ pháp luật và an toàn tài chính.
Các dịch vụ thuế tại MAN – Master Accountant Network
- Dịch vụ kế toán thuế
- Dịch vụ tư vấn thuế
- Dịch vụ quyết toán thuế
- Dịch vụ báo cáo thuế
- Dịch vụ hoàn thuế GTGT
Thông tin liên hệ dịch vụ tại MAN – Master Accountant Network
- Địa chỉ: Số 19A, Đường 43, Phường Tân Thuận, TP. Hồ Chí Minh
- Mobile/Zalo: 0903 963 163 – 0903 428 622
- Email: man@man.net.vn
- Google Business Profile: Xem Google Business Profile của MAN – Master Accountant Network
- LinkedIn Founder: Xem hồ sơ LinkedIn của chuyên gia Lê Hoàng Tuyên
Phụ trách sản xuất và kiểm duyệt nội dung chuyên môn bởi: Ông Lê Hoàng Tuyên – Sáng lập viên (Founder) & CEO MAN – Master Accountant Network, Kiểm toán viên CPA Việt Nam với hơn 30 năm kinh nghiệm trong lĩnh vực Kế toán, Kiểm toán, Thuế và Tư vấn Tài chính doanh nghiệp.
Giải đáp các câu hỏi thường gặp về Công văn 4113/QNI-QLDN2 (FAQ)
Công văn 4113/QNI-QLDN2 do cơ quan nào ban hành và áp dụng cho ai?
Công văn 4113/QNI-QLDN2 do Cục Thuế tỉnh Quảng Ninh ban hành ngày 17/8/2026. Văn bản áp dụng cho các doanh nghiệp Việt Nam, doanh nghiệp chế xuất có phát sinh giao dịch mua bán hàng hóa, linh kiện, nhập khẩu từ kho ngoại quan hoặc hợp đồng xây dựng, lắp đặt máy móc với nhà thầu nước ngoài.
Doanh nghiệp khai thuế nhà thầu theo tháng nhưng không phát sinh khấu trừ có phải nộp tờ khai không?
Theo Công văn 4113/QNI-QLDN2 và Thông tư 20/2026/TT-BTC, doanh nghiệp thực hiện nộp thay thuế theo tháng nếu trong tháng không phát sinh việc khấu trừ thuế đối với hàng hóa nhập khẩu từ kho ngoại quan, khu phi thuế quan để sản xuất hàng xuất khẩu thì không phải nộp hồ sơ khai thuế nhà thầu.
Thời hạn nộp tờ khai thuế nhà thầu theo từng lần phát sinh là bao lâu?
Căn cứ khoản 1 Điều 10 Nghị định 252/2026/NĐ-CP, thời hạn nộp hồ sơ khai thuế nhà thầu theo từng lần phát sinh chậm nhất là ngày thứ 10 kể từ ngày tiếp theo ngày phát sinh nghĩa vụ thuế.
Hồ sơ quyết toán thuế nhà thầu theo phương pháp trực tiếp gồm những biểu mẫu nào?
Theo Thông tư 89/2026/TT-BTC, bộ hồ sơ quyết toán gồm: Tờ khai quyết toán Mẫu số 02/NTNN, Phụ lục Bảng kê các nhà thầu nước ngoài Mẫu số 02-1/NTNN và Phụ lục Bảng kê các nhà thầu phụ Mẫu số 02-2/NTNN.
Hợp đồng xây dựng cung cấp máy móc cho DNCX có được hưởng thuế suất GTGT 0% không?
Phần giá trị dịch vụ xây dựng, lắp đặt máy móc cung cấp cho doanh nghiệp chế xuất được áp dụng thuế suất thuế GTGT 0% nếu đáp ứng đủ các điều kiện về hợp đồng, chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt qua ngân hàng và tờ khai hải quan (đối với phần máy móc thiết bị).
