Hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư là một trong những cơ chế quan trọng giúp doanh nghiệp giải phóng nguồn vốn, tái đầu tư và duy trì tính thanh khoản trong suốt giai đoạn triển khai xây dựng cơ bản. Theo Luật Thuế GTGT số 48/2024/QH15 có hiệu lực từ ngày 01/07/2025, các điều kiện và đối tượng thụ hưởng chính sách này đã có những thay đổi mang tính bước ngoặt, đặc biệt là đối với các lĩnh vực sản xuất đặc thù như xi măng, clinker.
Việc nắm vững quy định về hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư không chỉ giúp kế toán thực hiện đúng nghĩa vụ thuế mà còn bảo vệ tối đa lợi ích tài chính của đơn vị trước các đợt thanh kiểm tra. Bài viết này sẽ phân tích chi tiết các căn cứ pháp lý từ Nghị định 181/2025/NĐ-CP và Công văn 692/CT-CS, cung cấp cái nhìn toàn diện cho các chuyên gia tài chính và chủ doanh nghiệp.
Khung pháp lý về hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư từ năm 2025
Từ ngày 01/07/2025, hệ thống pháp luật về thuế giá trị gia tăng (GTGT) tại Việt Nam bước vào một giai đoạn mới với sự ra đời của Luật số 48/2024/QH15. Đây là văn bản pháp lý cao nhất điều chỉnh trực tiếp hoạt động hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư, thay thế cho nhiều quy định cũ vốn còn chồng chéo và gây khó khăn cho doanh nghiệp.
Song hành cùng Luật là Nghị định số 181/2025/NĐ-CP quy định chi tiết thi hành một số điều của Luật Thuế GTGT. Trong đó, Điều 30 của Nghị định này tập trung làm rõ quy trình, hồ sơ và các điều kiện bắt buộc để một dự án đầu tư được xét hoàn thuế. Việc cập nhật các văn bản này là nhiệm vụ tiên quyết của bộ phận kế toán thuế để tránh các rủi ro bị bác hồ sơ hoàn.
Để thực hiện thủ tục hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư một cách chính xác, doanh nghiệp cần căn cứ vào các văn bản sau:
- Luật số 48/2024/QH15: Quy định chung về đối tượng chịu thuế và hoàn thuế.
- Nghị định số 181/2025/NĐ-CP: Hướng dẫn chi tiết đối tượng không chịu thuế và hoàn thuế dự án đầu tư.
- Thông tư số 13/2023/TT-BTC: Hướng dẫn về hoàn thuế theo các nghị định trước đó.
- Công văn số 692/CT-CS ngày 27/01/2026: Hướng dẫn cụ thể về trường hợp dự án đầu tư triển khai trước ngày 01/07/2025.
Đối tượng được xét hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư
Quy định về hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư áp dụng cho các cơ sở kinh doanh nộp thuế theo phương pháp khấu trừ. Dự án phải thực hiện theo đúng quy định pháp luật về đầu tư, bao gồm dự án mới, dự án mở rộng hoặc dự án chia thành nhiều giai đoạn, hạng mục khác nhau.
Một điểm mới đáng chú ý là sự thay đổi trong danh mục hàng hóa chịu thuế. Theo Nghị định 181/2025/NĐ-CP, nếu sản phẩm như xi măng, clinker xuất khẩu không nằm trong danh mục không chịu thuế tại Phụ lục I và II, thì chúng thuộc diện chịu thuế GTGT. Điều này mở ra cơ hội hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư sản xuất các mặt hàng này.
Doanh nghiệp chỉ được nộp hồ sơ hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư khi số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết đạt từ 300 triệu đồng trở lên. Đây là ngưỡng tối thiểu để kích hoạt quy trình xét duyệt của cơ quan Thuế.
| Tiêu chí | Quy định chi tiết |
| Phương pháp tính thuế | Phải đăng ký nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ. |
| Tình trạng dự án | Đang trong giai đoạn đầu tư, chưa đi vào hoạt động kinh doanh. |
| Số thuế lũy kế | Số thuế GTGT chưa khấu trừ hết đạt từ 300.000.000 VNĐ trở lên. |
| Pháp lý đầu tư | Có giấy chứng nhận đầu tư hoặc quyết định chủ trương đầu tư hợp lệ. |
Hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư chuyển tiếp (trước 01/07/2025)
Theo Công văn 692/CT-CS, chính sách hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư có tính kế thừa rõ rệt. Các dự án thực hiện trước ngày 01/07/2025 nhưng vẫn đang trong giai đoạn đầu tư sau thời điểm này đều được hưởng lợi từ quy định mới.
Cụ thể, Điều 39 của Nghị định 181/2025/NĐ-CP quy định về điều khoản chuyển tiếp, cho phép doanh nghiệp áp dụng Điều 30 của Nghị định này để thực hiện thủ tục hoàn thuế. Đây là giải pháp giúp các dự án lớn có thời gian triển khai dài không bị gián đoạn về dòng tiền.
Phân định giai đoạn đầu tư và sản xuất
Để được hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư, doanh nghiệp cần xác định rõ thời điểm kết thúc giai đoạn đầu tư. Khi dự án bắt đầu phát sinh doanh thu từ sản xuất kinh doanh, số thuế đầu vào sau đó sẽ chuyển sang kê khai khấu trừ thay vì hoàn thuế diện dự án.
Lưu ý đối với các hạng mục hoàn thành từng phần
Trường hợp dự án chia thành nhiều hạng mục, việc hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư có thể thực hiện theo từng giai đoạn. Doanh nghiệp cần hạch toán riêng minh bạch các hóa đơn đầu vào cho từng hạng mục để giải trình cho cơ quan Thuế địa phương chính xác nhất.
Trường hợp đặc biệt: Sản phẩm Xi măng và Clinker
Từ ngày 01/07/2025, nếu xi măng và clinker không có tên trong danh mục không chịu thuế kèm theo Nghị định 181/2025/NĐ-CP, chúng sẽ trở thành đối tượng chịu thuế GTGT khi xuất khẩu. Đây là thay đổi quan trọng so với các quy định hạn chế trước đây.
Sự thay đổi này cho phép các nhà máy đang xây dựng được xét hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư. Điều này giúp giảm áp lực tài chính, giảm giá thành sản xuất và tăng sức cạnh tranh cho doanh nghiệp vật liệu xây dựng Việt Nam trên thị trường quốc tế.
Thủ tục và hồ sơ hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư theo chuẩn mới
Quy trình thực hiện hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư đòi hỏi sự chuẩn bị kỹ lưỡng về chứng từ. Mọi sai sót nhỏ trong hóa đơn hoặc hợp đồng đều có thể dẫn đến việc bị loại trừ số thuế được hoàn, gây thiệt hại tài chính nặng nề.
Doanh nghiệp cần đặc biệt lưu ý chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt cho hóa đơn trên 20 triệu đồng. Đồng thời, hồ sơ pháp lý dự án phải luôn khớp với thực tế triển khai để đảm bảo tính xác thực khi cơ quan thuế kiểm tra hiện trường.
Danh mục hồ sơ cần chuẩn bị
- Giấy đề nghị hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước (Mẫu số 01/HT).
- Bản sao giấy chứng nhận đầu tư hoặc quyết định chủ trương đầu tư.
- Bảng kê hóa đơn, chứng từ hàng hóa dịch vụ mua vào phục vụ dự án.
- Chứng từ thanh toán qua ngân hàng đối với hóa đơn giá trị lớn.
- Giải trình phân bổ thuế đầu vào (nếu có dự án chung với hoạt động hiện tại).
Thời gian giải quyết hồ sơ
Cơ quan Thuế sẽ tiến hành kiểm tra theo xếp hạng rủi ro của doanh nghiệp. Việc duy trì một hồ sơ sạch giúp quá trình hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư diễn ra nhanh chóng, thường trong vòng 6 đến 40 ngày làm việc tùy thuộc vào diện hồ sơ.
Các rủi ro thường gặp khi làm thủ tục hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư
Nhiều doanh nghiệp bị từ chối hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư do không phân định rõ giai đoạn đầu tư và sản xuất. Những lỗi phổ biến bao gồm hóa đơn phát sinh sau ngày hoạt động chính thức hoặc dự án chưa được cấp phép đầu tư hợp lệ.
Để hạn chế rủi ro, sử dụng dịch vụ tư vấn chuyên nghiệp từ MAN – Master Accountant Network là giải pháp tối ưu. Chúng tôi giúp doanh nghiệp rà soát toàn bộ hệ thống hóa đơn, chứng từ trước khi nộp hồ sơ hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư lên cơ quan chức năng.
Tóm tắt điều kiện hoàn thuế theo Luật số 48/2024/QH15
Bảng tổng hợp các điều kiện then chốt để doanh nghiệp tự đánh giá khả năng được hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư:
| Điều kiện | Yêu cầu bắt buộc | Lưu ý từ chuyên gia |
| Đối tượng | CSKD nộp thuế khấu trừ | Kiểm tra trạng thái MST doanh nghiệp. |
| Số thuế tối thiểu | >= 300 triệu VNĐ | Được bù trừ với thuế hoạt động hiện tại. |
| Tính hợp lệ | Hóa đơn GTGT đúng mẫu | Lưu ý đặc biệt hóa đơn điện tử có mã. |
| Thanh toán | Qua ngân hàng (> 20 triệu) | Phải có sao kê và ủy nhiệm chi rõ ràng. |
| Đầu ra | Đối tượng chịu thuế GTGT | Kiểm tra danh mục tại Nghị định 181/2025. |
Tại sao nên chọn dịch vụ tư vấn hoàn thuế tại MAN – Master Accountant Network?
Việc tự thực hiện hồ sơ hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư tiềm ẩn nhiều rủi ro pháp lý. MAN – Master Accountant Network với đội ngũ chuyên gia giàu kinh nghiệm sẽ là đối tác tin cậy bảo vệ dòng tiền của bạn.
Chúng tôi cung cấp giải pháp trọn gói:
- Kiểm tra tính pháp lý hồ sơ dự án đầu tư.
- Rà soát và chuẩn hóa hệ thống hóa đơn đầu vào.
- Đại diện giải trình trực tiếp với cơ quan Thuế.
- Tư vấn tối ưu hóa dòng tiền thông qua chính sách hoàn thuế.
Với MAN, quy trình hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư trở nên minh bạch, an toàn, giúp doanh nghiệp tập trung tối đa vào sản xuất kinh doanh.
Kết luận
Hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư là quyền lợi tài chính hợp pháp cần được doanh nghiệp ưu tiên bảo vệ. Trong bối cảnh quy định pháp luật thay đổi sau ngày 01/07/2025, sự chủ động cập nhật kiến thức và rà soát hồ sơ là yếu tố then chốt để thành công. Doanh nghiệp cần xác định rõ giai đoạn đầu tư và đảm bảo tính chính xác tuyệt đối của chứng từ thanh toán.
Hãy liên hệ ngay với MAN – Master Accountant Network để được hỗ trợ chuyên sâu các dịch vụ:
- Dịch vụ kiểm toán báo cáo quyết toán dự án đầu tư.
- Dịch vụ kế toán thuế, dịch vụ tư vấn thuế, dịch vụ quyết toán thuế và dịch vụ báo cáo thuế định kỳ.
- Hỗ trợ trọn gói thủ tục hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư.
Đừng để dòng vốn bị ứ đọng do thiếu sót thông tin. Hãy để MAN đồng hành cùng bạn trên con đường tuân thủ pháp luật thuế bền vững!
Thông tin liên hệ dịch vụ tại MAN – Master Accountant Network
- Địa chỉ: Số 19A, đường 43, phường Tân Thuận, TP. Hồ Chí Minh
- Mobile/Zalo: 0903 963 163 – 0903 428 622
- Email: man@man.net.vn
Phụ trách sản xuất nội dung bởi: Ông Lê Hoàng Tuyên – Sáng lập viên (Founder) & CEO MAN – Master Accountant Network, Kiểm toán viên CPA Việt Nam với hơn 30 năm kinh nghiệm trong ngành Kế toán, Kiểm toán và Tư vấn Tài chính.
Câu hỏi thường gặp về hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư
Có, dự án đầu tư mở rộng vẫn thuộc diện hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư nếu đáp ứng đủ điều kiện hạch toán riêng và quy định pháp luật đầu tư.
Doanh nghiệp không được hoàn ngay mà phải chuyển sang kỳ tiếp theo để khấu trừ lũy kế cho đến khi đạt ngưỡng 300 triệu đồng.
Nếu vẫn đang đầu tư sau 01/07/2025, doanh nghiệp áp dụng quy định hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư tại Nghị định 181/2025/NĐ-CP. Dự án đầu tư mở rộng có được hoàn thuế không?
Nếu số thuế chưa đủ 300 triệu đồng thì sao?
Dự án từ năm 2023 áp dụng luật nào?
