Công văn số 692/CT-CS ngày 27/1/2026 của Cục Thuế đã chính thức đưa ra những hướng dẫn then chốt về việc áp dụng chính sách hoàn thuế Giá trị gia tăng (GTGT) đối với các dự án đầu tư trong giai đoạn chuyển tiếp. Việc ban hành văn bản này có ý nghĩa đặc biệt quan trọng khi Luật số 48/2024/QH15 và Nghị định 181/2025/NĐ-CP bắt đầu đi vào thực thi, thay đổi căn bản điều kiện hoàn thuế cho doanh nghiệp.
Sự xuất hiện của Công văn số 692/CT-CS giúp cộng đồng kế toán và doanh nghiệp tháo gỡ nút thắt về việc liệu các dự án triển khai trước ngày 1/7/2025 có được hưởng các ưu đãi mới hay không. Trong bối cảnh ngành sản xuất xi măng và clinker đang đối mặt với các quy định khắt khe về thuế xuất khẩu, việc hiểu rõ tinh thần của công văn này là điều kiện tiên quyết để tối ưu hóa dòng tiền và tuân thủ đúng pháp luật. Hãy cùng MAN – Master Accountant Network phân tích chi tiết các nội dung dưới đây.
Bối cảnh pháp lý và hiệu lực của Công văn số 692/CT-CS

Trước khi đi sâu vào nội dung chi tiết, chúng ta cần xác lập các căn cứ pháp lý cốt lõi mà Công văn số 692/CT-CS đang trực tiếp hướng dẫn. Đây là nền tảng để cơ quan thuế ra quyết định xem xét hồ sơ hoàn thuế của doanh nghiệp.
Các văn bản pháp luật chi phối trực tiếp
Công văn số 692/CT-CS được xây dựng dựa trên sự tổng hòa của các văn bản pháp luật sau:
- Luật số 48/2024/QH15: Sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thuế giá trị gia tăng.
- Nghị định 181/2025/NĐ-CP: Quy định chi tiết thi hành một số điều của Luật Thuế GTGT mới, có hiệu lực từ ngày 1/7/2025.
- Danh mục sản phẩm tại Phụ lục I, II: Ban hành kèm theo Nghị định 181/2025/NĐ-CP liên quan đến hàng hóa xuất khẩu.
Đối tượng chịu tác động từ hướng dẫn tại Công văn số 692/CT-CS
Theo hướng dẫn, Công văn số 692/CT-CS tập trung vào hai nhóm đối tượng chính: các cơ sở kinh doanh nộp thuế khấu trừ có dự án đầu tư dở dang và các doanh nghiệp xuất khẩu khoáng sản. Việc xác định đúng đối tượng giúp kế toán tránh sai sót trong phân loại thuế GTGT đầu vào được hoàn.
Quy định về thuế GTGT đối với sản phẩm xi măng và clinker xuất khẩu
Một trong những điểm đáng lưu ý nhất được nhắc lại trong Công văn số 692/CT-CS chính là chính sách thuế đối với các mặt hàng khoáng sản đặc thù kể từ mốc thời gian 1/7/2025.
Phân loại mặt hàng theo Nghị định 181/2025/NĐ-CP
Từ ngày 1/7/2025, nếu xi măng, clinker không có tên trong Danh mục ban hành kèm Nghị định 181/2025/NĐ-CP thì sản phẩm xuất khẩu này sẽ thuộc đối tượng chịu thuế GTGT. Điều này khác biệt hoàn toàn so với các giai đoạn trước, khi nhiều mặt hàng khoáng sản xuất khẩu thuộc diện không chịu thuế GTGT.
Tác động đến hồ sơ hoàn thuế của doanh nghiệp
Việc Công văn số 692/CT-CS xác nhận trạng thái chịu thuế của hàng xuất khẩu mở ra cơ hội hoàn thuế đầu vào cho các dự án xây dựng dây chuyền sản xuất. Doanh nghiệp cần rà soát kỹ danh mục sản phẩm để đảm bảo quyền lợi về thuế tối đa theo quy định mới.
| Đặc điểm sản phẩm | Trạng thái thuế (Từ 1/7/2025) | Khả năng hoàn thuế đầu vào |
| Có tên trong Phụ lục I, II | Theo quy định cụ thể | Cần xét thêm điều kiện tỷ lệ khoáng sản |
| Không có tên trong Danh mục | Thuộc đối tượng chịu thuế GTGT | Được xem xét hoàn thuế theo quy định |
Điều kiện hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư theo Công văn số 692/CT-CS

Công văn số 692/CT-CS làm rõ các tiêu chí định lượng và định tính để một dự án đầu tư được phép thực hiện thủ tục hoàn thuế theo Luật số 48/2024/QH15.
Tiêu chí về phương pháp tính thuế và trạng thái dự án
Cơ sở kinh doanh phải đảm bảo đã đăng ký nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ. Theo Công văn số 692/CT-CS, dự án đầu tư (bao gồm nhiều giai đoạn) phải đang trong giai đoạn đầu tư và chưa đi vào hoạt động sản xuất kinh doanh chính thức.
Ngưỡng giá trị thuế GTGT đầu vào được hoàn
Theo Công văn số 692/CT-CS, số thuế GTGT đầu vào của dự án chưa được khấu trừ hết phải đạt từ 300 triệu đồng trở lên. Đây là ngưỡng tối thiểu để lập hồ sơ đề nghị hoàn thuế. Nếu chưa đạt, số thuế này sẽ được chuyển sang kỳ tiếp theo để bù trừ dần.
Hướng dẫn về dự án đầu tư nhiều giai đoạn
Đối với dự án chia thành nhiều giai đoạn, Công văn số 692/CT-CS cho phép cộng dồn thuế đầu vào của các hạng mục thuộc cùng một dự án. Quy định này tạo điều kiện thuận lợi cho các doanh nghiệp FDI hoặc nhà máy quy mô lớn đang thực hiện đầu tư cuốn chiếu.
Xử lý dự án chuyển tiếp: Trước và sau mốc 1/7/2025
Đây là nội dung cốt lõi nhất doanh nghiệp quan tâm khi nghiên cứu Công văn số 692/CT-CS. Câu hỏi về tính kế thừa chính sách đã được giải đáp thỏa đáng trong văn bản hướng dẫn này.
Áp dụng quy định cho dự án triển khai trước 1/7/2025
Nếu dự án thực hiện trước ngày 1/7/2025 mà vẫn dở dang sau khi Nghị định 181/2025/NĐ-CP có hiệu lực, doanh nghiệp vẫn được hoàn thuế. Công văn số 692/CT-CS khẳng định tính liên tục của chính sách, cho phép áp dụng Điều 30 Nghị định 181/2025/NĐ-CP cho các trường hợp này.
Điều này xác nhận tại Công văn số 692/CT-CS rằng chính sách mới không làm gián đoạn quyền lợi doanh nghiệp. Các chi phí phát sinh trước mốc này, nếu thuộc dự án đang dở dang, vẫn được gộp chung để xét hoàn thuế theo quy định mới nhất.
Quy định tại Điều 30 Nghị định 181/2025/NĐ-CP
Nghị định này chi tiết hóa các bước thực hiện và hồ sơ cần thiết cho doanh nghiệp. Công văn số 692/CT-CS lưu ý doanh nghiệp phải tuân thủ nghiêm ngặt quy định về chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt và hóa đơn hợp lệ cho tài sản dự án.
Phân tích số liệu và ví dụ minh họa về hoàn thuế dự án đầu tư
Để làm rõ hơn hướng dẫn tại Công văn số 692/CT-CS, chúng ta hãy xem xét bảng so sánh và ví dụ thực tế dưới đây về các thay đổi chính sách.
| Chỉ tiêu | Trước 1/7/2025 | Từ 1/7/2025 (Theo CV 692) |
| Căn cứ pháp lý | Luật số 13/2016/QH13 | Luật số 48/2024/QH15 |
| Ngưỡng hoàn thuế | 300 triệu đồng | 300 triệu đồng (giữ nguyên) |
| Đối tượng xi măng | Hạn chế hoàn thuế | Mở rộng nếu không thuộc danh mục |
| Tính chuyển tiếp | Theo quy định cũ | Được áp dụng Điều 30 NĐ 181/2025 |
Ví dụ thực tế: Công ty A xây nhà máy clinker từ 1/2025. Đến 6/2025, thuế đầu vào tích lũy là 200 triệu. Từ 7/2025 đến 12/2025, phát sinh thêm 150 triệu. Tổng cộng đạt 350 triệu đồng. Dựa trên Công văn số 692/CT-CS, Công ty A đủ điều kiện hoàn thuế vào đầu năm 2026.
Các bước chuẩn bị hồ sơ hoàn thuế theo tinh thần Công văn số 692/CT-CS

Để việc hoàn thuế diễn ra thuận lợi, doanh nghiệp cần chuẩn bị theo lộ trình mà Công văn số 692/CT-CS và các văn bản liên quan định hướng rõ ràng.
Bước 1: Rà soát tính pháp lý của dự án đầu tư
Cần đảm bảo dự án có đầy đủ Giấy chứng nhận đầu tư hoặc Quyết định chủ trương đầu tư hợp lệ. Công văn số 692/CT-CS nhấn mạnh việc dự án phải triển khai đúng mục tiêu và quy mô đã đăng ký ban đầu.
Bước 2: Tập hợp và phân loại hóa đơn chứng từ
Doanh nghiệp cần phân tách rõ hóa đơn GTGT sản xuất kinh doanh và hóa đơn dự án đầu tư. Theo Công văn số 692/CT-CS, chỉ những hóa đơn liên quan trực tiếp đến dự án mới được tính vào số thuế đề nghị hoàn kỳ này.
Bước 3: Kiểm tra điều kiện thanh toán
Mọi hóa đơn trên 20 triệu đồng bắt buộc phải có chứng từ thanh toán qua ngân hàng hợp lệ. Đây là lỗi phổ biến dẫn đến việc bị loại trừ số thuế khi cơ quan thuế kiểm tra hoàn thuế theo Công văn số 692/CT-CS.
Bước 4: Lập tờ khai 02/GTGT
Doanh nghiệp phải sử dụng mẫu tờ khai dành riêng cho dự án đầu tư. Việc kê khai sai mẫu tờ khai có thể khiến hồ sơ bị trả lại, gây chậm trễ trong việc thu hồi dòng tiền theo hướng dẫn của Công văn số 692/CT-CS.
Những rủi ro cần tránh khi áp dụng Công văn số 692/CT-CS
Dù Công văn số 692/CT-CS đã hướng dẫn chi tiết, thực tế kiểm toán tại MAN cho thấy doanh nghiệp vẫn thường gặp các rủi ro pháp lý cần lưu ý để bảo vệ quyền lợi.
- Rủi ro ngành nghề có điều kiện: Nếu chưa đáp ứng đủ điều kiện chuyên ngành, cơ quan thuế có quyền tạm dừng hoàn thuế theo Công văn số 692/CT-CS.
- Rủi ro về vốn góp: Vốn điều lệ chưa góp đủ theo tiến độ đăng ký là lý do khiến hồ sơ hoàn thuế bị bác bỏ nhanh chóng.
- Rủi ro về phân bổ thuế: Phân bổ không chính xác thuế GTGT dùng chung giữa dự án và sản xuất sẽ dẫn đến sai lệch số thuế được hoàn theo Công văn số 692/CT-CS.
Kết luận
Công văn số 692/CT-CS đã mở ra một hành lang pháp lý rõ ràng cho các dự án đầu tư chuyển tiếp. Việc nắm vững các mốc thời gian và điều kiện 300 triệu đồng là chìa khóa để quản trị dòng tiền hiệu quả trong năm 2026. Doanh nghiệp cần chủ động rà soát hồ sơ để tận dụng tối đa quyền lợi từ văn bản hướng dẫn này.
Nếu quý doanh nghiệp đang gặp khó khăn khi áp dụng Công văn số 692/CT-CS hoặc cần hỗ trợ hoàn thuế dự án đầu tư, hãy liên hệ ngay với MAN – Master Accountant Network. Chúng tôi cung cấp giải pháp chuyên sâu:
- Dịch vụ kiểm toán: Soát xét hồ sơ hoàn thuế, đảm bảo tính chuẩn xác trước cơ quan thuế.
- Kế toán thuế – Dịch vụ tư vấn thuế: Cập nhật công văn mới nhất như Công văn số 692/CT-CS.
- Quyết toán thuế và báo cáo thuế: Thực hiện trọn gói thủ tục, bảo vệ số liệu trước thanh tra.
Với đội ngũ chuyên gia tận tâm, MAN cam kết mang lại sự an tâm tuyệt đối cho doanh nghiệp trong mọi vấn đề về thuế và kế toán.
Thông tin liên hệ dịch vụ tại MAN – Master Accountant Network
- Địa chỉ: Số 19A, đường 43, phường Tân Thuận, TP. Hồ Chí Minh
- Mobile/Zalo: 0903 963 163 – 0903 428 622
- Email: man@man.net.vn
Phụ trách sản xuất nội dung bởi: Ông Lê Hoàng Tuyên – Sáng lập viên (Founder) & CEO MAN – Master Accountant Network, Kiểm toán viên CPA Việt Nam với hơn 30 năm kinh nghiệm trong ngành Kế toán, Kiểm toán và Tư vấn Tài chính.
Câu hỏi thường gặp liên quan đến Công văn số 692/CT-CS
Có, nếu dự án mở rộng thực hiện đúng quy định pháp luật đầu tư và đạt ngưỡng thuế GTGT đầu vào từ 300 triệu đồng trở lên chưa được khấu trừ hết.
Theo Công văn số 692/CT-CS, nếu khi chuyển sang khai thác mà số thuế chưa khấu trừ đạt ngưỡng, doanh nghiệp vẫn được thực hiện hồ sơ hoàn thuế cho giai đoạn đó.
Thông thường, dự án xây nhà để bán thực hiện bù trừ theo hoạt động sản xuất kinh doanh, không thuộc diện hoàn thuế dự án đầu tư như hướng dẫn tại Công văn số 692/CT-CS. Dự án đầu tư mở rộng có được hoàn thuế theo Công văn số 692/CT-CS?
Dự án kết thúc đầu tư vào tháng 8/2025 thì xử lý thế nào?
Công văn số 692/CT-CS áp dụng cho nhà để bán không?



