Công văn số 5537/ CT-CS ngày 25/11/2025 của Cục Thuế cung cấp hướng dẫn quan trọng về quyền và trách nhiệm của doanh nghiệp khi khai thiếu thuế. Nội dung công văn bao gồm các quy định về tiền chậm nộp, xử phạt vi phạm hành chính và các trường hợp doanh nghiệp được miễn xử phạt, giúp kế toán và CFO chuẩn bị hồ sơ đúng pháp luật.
Theo thống kê từ Tổng cục Thuế, trung bình mỗi năm có hơn 12% doanh nghiệp gặp tình trạng khai thiếu thuế do lỗi kế toán hoặc sai sót trong xác định nghĩa vụ. Công văn số 5537/ CT-CS giúp giảm thiểu rủi ro này bằng hướng dẫn cụ thể và căn cứ pháp lý rõ ràng. Đọc tiếp để nắm chi tiết cách áp dụng công văn trong thực tiễn kế toán – kiểm toán – thuế.
Tổng quan về công văn số 5537/ CT-CS
Công văn số 5537/ CT-CS được ban hành nhằm hướng dẫn doanh nghiệp thực hiện đúng quy định của Luật Quản lý thuế năm 2019, đặc biệt liên quan đến khai thiếu thuế. Đây là văn bản pháp lý quan trọng, giúp doanh nghiệp xác định rõ quyền lợi và trách nhiệm khi xảy ra sai sót.

Theo Điều 16, Điều 59, Điều 136, Điều 142 Luật Quản lý thuế 2019, doanh nghiệp phải tuân thủ các nguyên tắc về khai bổ sung, nộp tiền chậm nộp và xử phạt vi phạm hành chính. Công văn số 5537/ CT-CS hướng dẫn cụ thể cách áp dụng các điều luật này trong thực tế kế toán.
Tại sao doanh nghiệp cần quan tâm đến công văn số 5537/ CT-CS
Công văn số 5537/ CT-CS là công cụ quản lý rủi ro thuế giúp kế toán, CFO và chủ doanh nghiệp:
- Hiểu rõ quyền và trách nhiệm khi khai thiếu thuế.
- Thực hiện đúng nguyên tắc xử phạt và nộp tiền chậm nộp.
- Tối ưu chi phí, giảm rủi ro pháp lý.
Theo số liệu Tổng cục Thuế 2024, 85% doanh nghiệp nắm vững hướng dẫn pháp luật giảm được trung bình 30% số tiền phạt vi phạm hành chính về thuế.
Quyền không bị xử phạt theo công văn số 5537/ CT-CS
Hiểu rõ quyền không bị xử phạt theo công văn số 5537/ CT-CS giúp doanh nghiệp giảm rủi ro khi khai thiếu thuế. Theo Khoản 11 Điều 16 Luật Quản lý thuế 2019, nếu thực hiện đúng hướng dẫn và quyết định của cơ quan thuế, doanh nghiệp không bị xử phạt và không phải nộp tiền chậm nộp. Việc tuân thủ hướng dẫn này đảm bảo doanh nghiệp được miễn phạt ngay cả khi khai thiếu, giúp kế toán và CFO quản lý thuế hiệu quả, minh bạch và đúng pháp luật.
Cơ sở pháp lý
Theo Khoản 11 Điều 16 Luật Quản lý thuế 2019, doanh nghiệp sẽ không bị xử phạt vi phạm hành chính và không bị tính tiền chậm nộp nếu thực hiện theo hướng dẫn và quyết định của cơ quan thuế hoặc cơ quan nhà nước có thẩm quyền.
Áp dụng thực tế

Trong trường hợp kế toán thực hiện đúng theo văn bản hướng dẫn của cơ quan thuế, nếu phát hiện khai thiếu, doanh nghiệp sẽ được miễn xử phạt. Đây là điểm quan trọng mà công văn số 5537/ CT-CS nhấn mạnh để giảm rủi ro tài chính không cần thiết.
Trách nhiệm nộp tiền chậm nộp theo công văn số 5537/ CT-CS
Trách nhiệm nộp tiền chậm nộp theo công văn số 5537/ CT-CS là nội dung quan trọng mà doanh nghiệp cần nắm. Theo Điều 59 Luật Quản lý thuế 2019, nếu chậm nộp thuế, khai bổ sung tăng số thuế hoặc bị phát hiện khai thiếu, doanh nghiệp phải nộp tiền chậm nộp. Công văn hướng dẫn cách tính tiền chậm nộp 0,03%/ngày và thời hạn nộp, giúp kế toán và CFO lập hồ sơ bổ sung kịp thời, giảm thiểu rủi ro và đảm bảo tuân thủ pháp luật.
Cơ sở pháp lý
Điều 59 Luật Quản lý thuế 2019 quy định doanh nghiệp phải nộp tiền chậm nộp nếu:
- Chậm nộp thuế so với thời hạn quy định.
- Khai bổ sung làm tăng số thuế phải nộp.
- Bị cơ quan thuế phát hiện khai thiếu thuế.
| Nội dung vi phạm | Số tiền thuế thiếu | Tiền chậm nộp 0.03%/ngày | Tổng tiền phải nộp |
| Khai thiếu VAT tháng 5 | 100.000.000 VND | 900.000 VND (30 ngày) | 100.900.000 VND |
| Khai thiếu thuế TNDN quý 2 | 200.000.000 VND | 1.800.000 VND (30 ngày) | 201.800.000 VND |
Áp dụng trong doanh nghiệp
Doanh nghiệp cần lập hồ sơ bổ sung kịp thời để giảm thiểu tiền phạt và tiền chậm nộp. Công văn số 5537/ CT-CS hướng dẫn chi tiết cách tính tiền chậm nộp và thời hạn nộp, giúp CFO và kế toán chuẩn bị kế hoạch thanh toán hợp lý.
Nguyên tắc xử phạt vi phạm hành chính theo công văn số 5537/ CT-CS
Nguyên tắc xử phạt vi phạm hành chính theo công văn số 5537/ CT-CS giúp doanh nghiệp hiểu rõ mức xử phạt khi khai thiếu thuế. Theo Điều 136 Luật Quản lý thuế 2019, xử phạt thực hiện theo quy định quản lý thuế và luật xử lý vi phạm hành chính; nếu vi phạm hóa đơn dẫn đến thiếu thuế, doanh nghiệp chỉ bị xử phạt về thuế, không xử phạt hóa đơn. Công văn cũng hướng dẫn giảm nhẹ phạt khi doanh nghiệp khai bổ sung và nộp đủ số thuế, giúp kế toán và CFO quản lý hồ sơ thuế hiệu quả.
Cơ sở pháp lý

Theo Điều 136 Luật Quản lý thuế 2019, xử phạt vi phạm hành chính thực hiện theo quy định về quản lý thuế và pháp luật xử lý vi phạm hành chính. Nếu vi phạm về hóa đơn không hợp pháp dẫn đến thiếu thuế, doanh nghiệp chỉ bị xử phạt về quản lý thuế, không xử phạt về hóa đơn.
| Hành vi vi phạm | Mức phạt tối đa |
| Khai sai dẫn đến thiếu thuế | 40% số thuế phải nộp thêm |
| Trốn thuế | 3 lần số thuế trốn |
| Khai sai tăng số tiền được miễn, giảm, hoàn | 20% số thuế được hưởng thêm |
Lưu ý cho doanh nghiệp
Kế toán, CFO cần kiểm tra kỹ chứng từ và hóa đơn trước khi nộp hồ sơ thuế để tránh bị xử phạt. Công văn số 5537/ CT-CS cung cấp hướng dẫn giảm nhẹ phạt nếu doanh nghiệp thực hiện khai bổ sung và nộp đủ thuế.
Xử lý khai sai dẫn đến thiếu thuế theo công văn số 5537/ CT-CS
Xử lý khai sai dẫn đến thiếu thuế theo công văn số 5537/ CT-CS hướng dẫn doanh nghiệp cách khắc phục khi phát hiện sai sót. Theo Điều 142 Luật Quản lý thuế 2019, nếu khai sai và đã phản ánh đầy đủ trên sổ kế toán, chứng từ hợp pháp, doanh nghiệp phải khai bổ sung, nộp đủ thuế và tiền chậm nộp, đồng thời có thể bị xử phạt vi phạm hành chính. Ví dụ thực tế cho thấy, việc tuân thủ công văn giúp giảm mức phạt đáng kể, bảo đảm tuân thủ pháp luật và quản lý rủi ro thuế hiệu quả.
Cơ sở pháp lý
Điều 142 Luật Quản lý thuế 2019 quy định: nếu khai sai dẫn đến thiếu số thuế phải nộp và đã phản ánh đầy đủ trên sổ kế toán, chứng từ hợp pháp, doanh nghiệp phải:

- Khai bổ sung và nộp đủ thuế.
- Nộp tiền chậm nộp.
- Có thể bị xử phạt vi phạm hành chính về quản lý thuế.
Ví dụ thực tế
Một công ty thương mại khai thiếu VAT 100 triệu VND, lập hồ sơ bổ sung và nộp tiền chậm nộp trong 15 ngày. Nhờ tuân thủ công văn số 5537/ CT-CS, công ty chỉ bị phạt 20 triệu VND thay vì 40 triệu VND.
Lưu ý quan trọng khác từ công văn số 5537/ CT-CS
Để áp dụng đúng hướng dẫn trong công văn số 5537/ CT-CS, doanh nghiệp cần chú ý một số điểm quan trọng liên quan đến chứng từ, hướng dẫn của cơ quan thuế và hệ thống kế toán. Việc thực hiện đúng các lưu ý này giúp giảm thiểu rủi ro xử phạt và đảm bảo tuân thủ pháp luật.
| Lưu ý | Nội dung chi tiết |
| Lưu trữ chứng từ hợp pháp | Hóa đơn, chứng từ phải đầy đủ và hợp pháp để chứng minh khi cơ quan thuế kiểm tra, đảm bảo quyền không bị xử phạt. |
| Tuân thủ hướng dẫn của cơ quan thuế | Doanh nghiệp nên thực hiện đúng các hướng dẫn để tránh bị xử phạt không cần thiết, tuân theo nguyên tắc cốt lõi của công văn. |
| Phản ánh đầy đủ trên hệ thống kế toán | Mọi khai báo bổ sung phải đúng và đầy đủ trên hệ thống kế toán, tránh thiếu minh bạch dẫn đến mức phạt nặng hơn. |
Mối liên hệ giữa công văn số 5537/ CT-CS và kiểm toán
Trong kiểm toán báo cáo tài chính, việc khai thiếu thuế nếu không được xử lý kịp thời sẽ ảnh hưởng đến số liệu kế toán và đánh giá rủi ro. Công văn số 5537/ CT-CS giúp kiểm toán viên đánh giá chính xác các khoản thuế phải nộp, tiền chậm nộp và mức phạt, đảm bảo báo cáo tài chính trung thực và hợp pháp.
Ứng dụng thực tiễn của công văn số 5537/ CT-CS trong kế toán – thuế
- Lập kế hoạch nộp thuế theo đúng hạn, tránh tiền chậm nộp.
- Khai bổ sung khi phát hiện sai sót, giảm mức phạt.
- Kiểm soát chứng từ, hóa đơn để áp dụng quyền không bị xử phạt.
- Hướng dẫn chi tiết từ công văn giúp doanh nghiệp tuân thủ pháp luật, giảm rủi ro và tối ưu chi phí.
Kết luận
Công văn số 5537/ CT-CS là văn bản pháp lý quan trọng, giúp doanh nghiệp hiểu rõ quyền và trách nhiệm khi khai thiếu thuế. Việc nắm vững công văn giúp kế toán và CFO đảm bảo tuân thủ pháp luật, giảm thiểu rủi ro về tiền chậm nộp và mức phạt vi phạm hành chính.
Ứng dụng công văn số 5537/ CT-CS trong thực tế kế toán thuế – kiểm toán – thuế giúp doanh nghiệp lập hồ sơ minh bạch, khai bổ sung kịp thời và tối ưu chi phí. MAN – Master Accountant Network sẵn sàng hỗ trợ tư vấn, triển khai dịch vụ kế toán, kiểm toán và thuế trọn gói, giúp doanh nghiệp thực hiện đúng pháp luật và giảm thiểu rủi ro.
Thông tin liên hệ dịch vụ tại MAN – Master Accountant Network
- Địa chỉ: Số 19A, đường 43, phường Tân Thuận, TP. Hồ Chí Minh
- Mobile/Zalo: 0903 963 163 – 0903 428 622
- Email: man@man.net.vn
Phụ trách sản xuất nội dung bởi: Ông Lê Hoàng Tuyên – Sáng lập viên (Founder) & CEO MAN – Master Accountant Network, Kiểm toán viên CPA Việt Nam với hơn 30 năm kinh nghiệm trong ngành Kế toán, Kiểm toán và Tư vấn Tài chính.




