Công văn số 246/ CT-CS ngày 15/01/2026 của Cục Thuế là văn bản định hướng quan trọng, giải quyết vướng mắc về hóa đơn và kê khai thuế. Việc ra đời của công văn này nhằm làm rõ các quy định mới tại Nghị định số 70/2025/NĐ-CP, bổ sung cho Nghị định 123/2020/NĐ-CP. Đối với kế toán và kiểm toán, nội dung này là cơ sở pháp lý trọng yếu để bảo vệ doanh nghiệp trước rủi ro thanh tra.
Sự xuất hiện của Công văn số 246/ CT-CS giúp doanh nghiệp nắm bắt kịp thời thay đổi về lập hóa đơn và phân bổ thuế GTGT tập trung. Trong bối cảnh ngành thuế siết chặt quản lý rủi ro, việc tuân thủ các trích dẫn pháp luật như Điều 4 và Điều 13 là yêu cầu bắt buộc. Bài viết dưới đây sẽ phân tích sâu khía cạnh kỹ thuật chuyên ngành để quý độc giả có cái nhìn toàn diện nhất.
Tổng quan về cơ sở pháp lý của Công văn số 246/ CT-CS

Để hiểu rõ Công văn số 246/ CT-CS, chúng ta cần nhìn vào hệ thống văn bản quy phạm pháp luật được Cục Thuế trích dẫn. Đây là sự kết hợp giữa các nghị định gốc và các thông tư hướng dẫn chi tiết về phân bổ nghĩa vụ thuế địa phương.
Sự liên kết giữa Nghị định 123/2020/NĐ-CP và Nghị định 70/2025/NĐ-CP
Nghị định 123 là xương sống của hệ thống hóa đơn điện tử tại Việt Nam. Tuy nhiên, một số quy định cần cập nhật để phù hợp thực tế kinh doanh đa ngành. Công văn số 246/ CT-CS nhấn mạnh vào điểm a khoản 3 Điều 1 của Nghị định số 70/2025/NĐ-CP, chuẩn hóa nguyên tắc lập và quản lý hóa đơn.
Việc sửa đổi này tập trung vào tính minh bạch và thời điểm xuất hóa đơn đối với các trường hợp đặc thù. Kế toán cần lưu ý các quy định tại Công văn số 246/ CT-CS để tránh bị xử phạt do lập hóa đơn sai thời điểm. Việc nắm vững các điều khoản bổ sung sẽ giúp doanh nghiệp tối ưu hóa quy trình chứng từ.
Vai trò của Thông tư 80/2021/TT-BTC trong việc phân bổ thuế
Bên cạnh vấn đề hóa đơn, Công văn số 246/ CT-CS còn giải quyết bài toán kê khai thuế GTGT cho tập đoàn có nhiều chi nhánh. Thông tư 80/2021/TT-BTC quy định rõ về việc hạch toán tập trung và nộp thuế tại nơi có địa điểm kinh doanh khác tỉnh trụ sở chính.
Sự hướng dẫn của Công văn số 246/ CT-CS giúp loại bỏ tranh cãi về địa điểm nộp hồ sơ khai thuế. Điều này đảm bảo dòng tiền thuế được phân bổ công bằng giữa các địa phương theo tỷ lệ doanh thu phát sinh thực tế. Đây là căn cứ quan trọng để kế toán thực hiện đúng nghĩa vụ ngân sách.
Phân tích nội dung chi tiết Công văn số 246/ CT-CS về hóa đơn
Trong mục 1 của Công văn số 246/ CT-CS, Cục Thuế lưu tâm đến hai khía cạnh: Nguyên tắc lập hóa đơn và sử dụng phiếu xuất kho kiêm vận chuyển nội bộ.
Nguyên tắc lập và sử dụng hóa đơn theo Công văn số 246/ CT-CS
Căn cứ khoản 1 Điều 4 Nghị định số 123/2020/NĐ-CP, việc lập hóa đơn phải đảm bảo đầy đủ các tiêu thức bắt buộc. Công văn số 246/ CT-CS chỉ rõ mọi giao dịch bán hàng, dịch vụ phải được ghi nhận ngay trên hệ thống điện tử. Việc này áp dụng cho cả hóa đơn có mã hoặc không có mã của cơ quan thuế.
Dưới đây là bảng tổng hợp các tiêu chí quan trọng khi thực hiện theo hướng dẫn của Công văn số 246/ CT-CS:
| Tiêu chí | Quy định cũ (NĐ 123) | Quy định mới (NĐ 70 & CV 246) |
| Thời điểm lập | Khi chuyển giao sở hữu/sử dụng | Siết chặt dịch vụ hoàn thành từng phần |
| Chứng từ vận chuyển | Tùy chọn hóa đơn/phiếu xuất kho | Bắt buộc phiếu điện tử cho nội bộ |
| Mã cơ quan thuế | Theo lộ trình | Phổ cập cho doanh nghiệp rủi ro cao |
Phiếu xuất kho kiêm vận chuyển nội bộ và hàng gửi bán đại lý
Một điểm mới trong Công văn số 246/ CT-CS là áp dụng hóa đơn điện tử cho các trường hợp cụ thể theo yêu cầu quản lý. Khi doanh nghiệp điều chuyển hàng giữa các kho nội bộ hoặc gửi đại lý, việc sử dụng phiếu xuất kho điện tử là bắt buộc. Điều này giúp cơ quan chức năng kiểm soát luồng hàng lưu thông.
Việc không tuân thủ quy định này, theo Công văn số 246/ CT-CS, có thể khiến hàng hóa bị coi là không có chứng từ hợp pháp. Rủi ro bị tạm giữ hàng và xử phạt hành chính là rất cao. Kế toán kho cần phối hợp chặt chẽ với bộ phận thuế để phát hành chứng từ đúng quy trình.
Kê khai và nộp thuế GTGT theo hướng dẫn của Công văn số 246/ CT-CS

Mục 2 của Công văn số 246/ CT-CS tập trung vào Nghị định 126/2020/NĐ-CP và Thông tư 80/2021/TT-BTC. Các văn bản này giải quyết vướng mắc về địa điểm và phương thức phân bổ nghĩa vụ thuế cho các đơn vị phụ thuộc.
Địa điểm nộp hồ sơ khai thuế
Theo Công văn số 246/ CT-CS, doanh nghiệp cần xác định rõ mô hình hoạt động là hạch toán độc lập hay phụ thuộc. Căn cứ Điều 11 Nghị định 126/2020/NĐ-CP, hồ sơ khai thuế nộp tại cơ quan quản lý trực tiếp trụ sở chính. Tuy nhiên, nếu có đơn vị phụ thuộc tại tỉnh khác, việc nộp thuế phải tuân theo nguyên tắc phân bổ.
Công thức phân bổ nghĩa vụ thuế GTGT
Dựa trên Thông tư 80/2021/TT-BTC tại Công văn số 246/ CT-CS, việc phân bổ thuế GTGT chi nhánh được tính theo tỷ lệ doanh thu. Điều này đảm bảo quyền lợi ngân sách cho địa phương có hoạt động sản xuất thực tế. Kế toán cần tính toán chính xác số liệu để thực hiện kê khai mẫu 01/GTGT.
Bảng ví dụ tính phân bổ theo Công văn số 246/ CT-CS:
Giả sử Công ty A tại Hà Nội có chi nhánh sản xuất tại Quảng Ngãi (phụ thuộc).
- Tổng thuế GTGT phải nộp hệ thống: 1.000.000.000 VNĐ.
- Doanh thu tại chi nhánh Quảng Ngãi chiếm 30% tổng doanh thu.
- Số thuế phân bổ về Quảng Ngãi: 1.000.000.000 x 2% = 20.000.000 VNĐ (theo tỷ lệ quy định).
Lưu ý: Tỷ lệ phân bổ được áp dụng tùy thuộc vào loại hình chi nhánh là sản xuất hay dịch vụ đặc thù.
Các lưu ý quan trọng dành cho kế toán từ Công văn số 246/ CT-CS

Khi thực thi nghiệp vụ dựa trên Công văn số 246/ CT-CS, kế toán trưởng cần rà soát lại hệ thống ERP và phần mềm. Việc đảm bảo tương thích với các mẫu biểu và quy trình mới là điều kiện tiên quyết để vận hành trôi chảy.
Rà soát danh mục hóa đơn điện tử
Công văn số 246/ CT-CS nhắc nhở về quản lý rủi ro hóa đơn từ doanh nghiệp “bỏ địa chỉ kinh doanh”. Việc tra cứu thường xuyên trên cổng thông tin Tổng cục Thuế là cần thiết. Điều này giúp đảm bảo hóa đơn đầu vào phù hợp tinh thần Nghị định 123 và Công văn số 246/ CT-CS.
Đối soát dữ liệu giữa các địa phương
Vì Công văn số 246/ CT-CS đề cập sâu đến phân bổ thuế, doanh nghiệp cần đối soát chặt chẽ số liệu trụ sở và chi nhánh. Tránh tình trạng nộp thừa tại trụ sở nhưng nợ thuế tại chi nhánh. Việc này giúp tránh bị cưỡng chế hóa đơn hoặc tính tiền chậm nộp không đáng có.
Xử lý các trường hợp sai sót hóa đơn
Nếu phát hiện sai sót sau khi gửi dữ liệu, kế toán căn cứ quy trình tại Nghị định 123 mà Công văn số 246/ CT-CS dẫn chiếu. Tùy tính chất sai sót (sai thông tin hay sai tiền thuế) mà thực hiện điều chỉnh hoặc thay thế. Quy trình xử lý cần được lập biên bản rõ ràng để làm căn cứ giải trình.
Tầm nhìn quản lý thuế năm 2026 thông qua Công văn số 246/ CT-CS
Nhìn vào Công văn số 246/ CT-CS, chúng ta thấy rõ xu hướng minh bạch hóa dòng vốn và hàng hóa. Sự kết hợp giữa hóa đơn điện tử và cơ chế phân bổ giúp quản lý hiệu quả hoạt động kinh doanh xuyên biên giới hành chính. Đây là bước tiến lớn trong công tác chuyển đổi số của ngành thuế.
Hiểu đúng Công văn số 246/ CT-CS không chỉ là câu chuyện con số, mà là tư duy quản trị rủi ro pháp lý. Doanh nghiệp nên chủ động đào tạo đội ngũ, cập nhật bản tin thuế thường xuyên. Điều này giúp doanh nghiệp không lạc hậu trước những thay đổi nhanh chóng của chính sách thuế hiện đại.
Kết luận
Công văn số 246/ CT-CS minh chứng cho sự phức tạp và tính cập nhật liên tục của quy định thuế Việt Nam. Việc nắm bắt quy định hóa đơn và phân bổ thuế theo Thông tư 80 là chìa khóa để vận hành ổn định. Giá trị của Công văn số 246/ CT-CS nằm ở việc chuẩn hóa quy trình, tạo sự thống nhất giữa cơ quan thuế và người nộp.
Nếu doanh nghiệp gặp khó khăn khi thực thi nội dung tại Công văn số 246/ CT-CS, MAN – Master Accountant Network sẵn sàng đồng hành. Chúng tôi cung cấp các giải pháp chuyên nghiệp giúp tối ưu hóa bộ máy kế toán:
- Dịch vụ kế toán thuế & Báo cáo thuế: Đảm bảo chính xác theo tinh thần Công văn số 246/ CT-CS.
- Dịch vụ kiểm toán: Soát xét rủi ro tuân thủ pháp luật thuế toàn diện.
- Dịch vụ tư vấn thuế & Quyết toán thuế: Hỗ trợ giải trình và tối ưu nghĩa vụ thuế hợp pháp.
Hãy liên hệ ngay với MAN để được tư vấn bởi đội ngũ chuyên gia giàu kinh nghiệm. Chúng tôi giúp doanh nghiệp an tâm phát triển bền vững trong môi trường pháp lý đầy biến động.
Thông tin liên hệ dịch vụ tại MAN – Master Accountant Network
- Địa chỉ: Số 19A, đường 43, phường Tân Thuận, TP. Hồ Chí Minh
- Mobile/Zalo: 0903 963 163 – 0903 428 622
- Email: man@man.net.vn
Phụ trách sản xuất nội dung bởi: Ông Lê Hoàng Tuyên – Sáng lập viên (Founder) & CEO MAN – Master Accountant Network, Kiểm toán viên CPA Việt Nam với hơn 30 năm kinh nghiệm trong ngành Kế toán, Kiểm toán và Tư vấn Tài chính.
Giải đáp thắc mắc thường gặp về Công văn số 246/ CT-CS
Các căn cứ pháp lý trong Công văn số 246/ CT-CS là nghị định và thông tư áp dụng toàn quốc. Do đó, doanh nghiệp ở các địa phương khác hoàn toàn có thể tham khảo thực hiện tương tự để đảm bảo tính tuân thủ.
Vì Nghị định 70 là văn bản mới nhất sửa đổi một số điều của Nghị định 123. Công văn số 246/ CT-CS cập nhật trích dẫn này giúp người nộp thuế áp dụng đúng quy định còn hiệu lực tại thời điểm năm 2026.
Việc này sẽ dẫn đến kê khai sai nghĩa vụ thuế tại từng địa phương. Cơ quan thuế có quyền ấn định thuế và xử phạt vi phạm hành chính về thời hạn nộp hồ sơ cũng như tiền chậm nộp phát sinh.
Không. Theo Công văn số 246/ CT-CS, việc điều chuyển hàng hóa giữa các đơn vị trực thuộc để theo dõi, xuất bán phải dùng Phiếu xuất kho điện tử. Hóa đơn bán hàng chỉ xuất khi thực sự có giao dịch chuyển quyền sở hữu hàng hóa.
Công văn số 246/ CT-CS áp dụng cho tất cả tỉnh thành không?
Tại sao Công văn số 246/ CT-CS trích dẫn Nghị định 70/2025/NĐ-CP?
Nếu không phân bổ thuế theo Thông tư 80 như Công văn số 246/ CT-CS hướng dẫn thì sao?
Chứng từ vận chuyển nội bộ có thay thế bằng hóa đơn bán hàng không?



